El objetivo más importante del programa de Ciencias en el CIM-ORT es enseñar a los alumnos los conceptos científicos a través del entendimiento de los procesos que estudia la ciencia, dentro de un contexto que les permita resolver el por qué, cómo y para qué de los fenómenos y la relación de esos fenómenos con su vida cotidiana. El estudio de las ciencias con este enfoque, deberá ayudar a desarrollar el pensamiento científico de los alumnos, lo cual contribuirá al desarrollo de sus capacidades analíticas y críticas, haciendo de la ciencia parte del bagaje cultural de los alumnos.

Nuestra escuela cuenta con laboratorios adecuados para la enseñanza de las ciencias desde el preescolar hasta el bachillerato. En la primaria, contamos además con el Hábitat, un aula al aire libre en donde nuestros alumnos aprenden con la observación y la experimentación directa con la naturaleza. Esta aula también es utilizada por los demás departamentos del Colegio. Los laboratorios que comparten la secundaria y la preparatoria cuentan con equipos sofisticados y con tecnología multimedia para el desarrollo de clases y prácticas que enriquecen el curriculum de cada una de las materias impartidas.

Otros proyectos relacionados con  la enseñanza de las ciencias incluyen el cultivo de especies en 5º. de primaria, un proyecto de reforestación en 6º de primaria y el proyecto “La ciencia se va de viaje” en 1º. de secundaria.